Die Europäische Union und ihre Mitgliedstaaten spielen eine wichtige Rolle in der internationalen Entwicklungszusammenarbeit. Die EU ist weltweit der größte Geber in den Bereichen Armutsbekämpfung und wirtschaftliche Entwicklung. Viele zentrale Entscheidungen der Entwicklungszusammenarbeit werden heute in Brüssel getroffen. Die Stiftung Weltbevölkerung will diese Entscheidungen frühzeitig begleiten. Deshalb unterhält sie seit dem Jahr 2000 ein eigenes Brüsseler Verbindungsbüro.

In Brüssel arbeitet die Stiftung Weltbevölkerung in engem Austausch mit Mitgliedern des Europäischen Parlaments, der EU-Kommissionen, Vertretern von Mitgliedstaaten und in gemeinsamen Kampagnen mit anderen Nichtregierungsorganisationen. Sie setzt sich hierbei für entwicklungspolitische Initiativen ein, die sexuelle und reproduktive Gesundheit sowie Fragen der Bevölkerungsentwicklung stärker in den Fokus nehmen.